dc.contributor.author | Ferreira, Pedro Henrique Narciso | |
dc.date.accessioned | 2021-11-22T14:58:57Z | |
dc.date.available | 2021-11-22T14:58:57Z | |
dc.date.issued | 2021-11-11 | |
dc.identifier.citation | FERREIRA, Pedro Henrique Narciso. Os cromossomos sexuais como fonte geradora de diferenciação genética. O gênero Pyrrhulina (Characiformes, Lebiasinidae) como modelo. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2021. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/15137. | * |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/15137 | |
dc.description.abstract | Allopatric processes are generally considered among the main causes of the striking
Neotropical biodiversity. However, the role of chromosomal rearrangements and neo-sex
chromosomes in genetic diversity and speciation remains still little investigated. Here, we
aimed to infer the relative contribution of allopatry, chromosomal rearrangements, and sex
chromosomes to genetic divergence in five Pyrrhulina species using population genomic
analyses coupled with cytogenetic data. Our results highlighted that the distribution of the
genetic diversity is consistent with their chromosomal and geographical data and was mainly
influenced by long-distance allopatry. The results of PCoA indicated a clear clustering of
species located in the same geographical region, except for P. semifasciata, that is in sympatry
with P. brevis. In fastStructure K=4 result, only P. australis and P. marilynae were grouped,
and with K=3 P. obermulleri and P. brevis were further combined. In this case, geographically
close species showed genetically similarity, indicating speciation mechanisms that are largely
dependent of allopatry. The effect of allopatry also were amplified when coupled with the
occurrence of chromosomal rearrangements, as observed for P. marilynae, the species with
highly rearranged karyotype (2n=32). Besides, the genetic structure analyzes indicated great
differentiation in P. semifasciata, suggesting that the presence of the X1X2Y sex chromosome
system, exclusively present in individuals of this species, caused high genetic differentiation
and showing that such effect was significant even in sympatry. In summary, the distribution of
genetic diversity among the analyzed species is mainly influenced long-distance allopatry, but
the occurrence of chromosomal rearrangements, especially the sex-related ones contributed to
the fixation of genetic differences which may lead to reproductive isolation and a consequent
speciation process within the genus | eng |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | por |
dc.language.iso | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de São Carlos | por |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | Peixes | por |
dc.subject | Cromossomos Sexuais | por |
dc.subject | Diversidade Genética | por |
dc.subject | SNPs | por |
dc.subject | Especiação | por |
dc.subject | Alopatria | por |
dc.subject | Fish | eng |
dc.subject | Sex chromosomes | eng |
dc.subject | Genetic diversity | eng |
dc.subject | Speciation | eng |
dc.subject | Allopatry | eng |
dc.title | Os cromossomos sexuais como fonte geradora de diferenciação genética. O gênero Pyrrhulina (Characiformes, Lebiasinidae) como modelo | por |
dc.title.alternative | Sex chromosomes as a source of genetic differentiation. The genus Pyrrhulina (Characiformes, Lebiasinidae) as a model | eng |
dc.type | TCC | por |
dc.contributor.advisor1 | Cioffi, Marcelo de Bello | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/0242034365085727 | por |
dc.description.resumo | Os processos alopátricos são geralmente considerados uma das principais causas da notável
biodiversidade da região Neotropical. No entanto, o papel dos rearranjos cromossômicos e
dos cromossomos neo-sexuais na diversidade genética e especiação ainda é pouco
investigado. Aqui, nosso objetivo foi inferir a contribuição relativa da alopatria, rearranjos
cromossômicos e cromossomos sexuais para a divergência genética em cinco espécies de
Pyrrhulina usando análises genômicas populacionais juntamente com dados citogenéticos.
Nossos resultados destacaram que a distribuição da diversidade genética é consistente com
seus dados cromossômicos e geográficos e foi influenciada principalmente pela alopatria de
longa distância. Os resultados da PCoA indicaram um claro agrupamento de espécies
localizadas na mesma região geográfica, exceto para P. semifasciata, que está em simpatria
com P. brevis. No resultado do fastSTRUCTURE K = 4, apenas P. australis e P. marilynae
foram agrupadas, e com K = 3 P. obermulleri e P. brevis foram posteriormente combinados.
Neste caso, mostrou que espécies próximas geograficamente são geneticamente semelhantes,
indicando mecanismos de especiação que são amplamente dependentes da alopatria. O efeito
da alopatria também foi amplificado quando acoplado à ocorrência de rearranjos
cromossômicos, como observado para P. marilynae, a espécie com cariótipo altamente
rearranjado (2n = 32). Além disso, a estrutura genética indicou grande diferenciação em P.
semifasciata, evidenciando que a presença do sistema cromossômico sexual X1X2Y, presente
exclusivamente em indivíduos desta espécie, causou alta diferenciação genética e mostrando
que tal efeito foi significativo mesmo na simpatria. Em suma, a distribuição da diversidade
genética entre as espécies analisadas é influenciada principalmente pela alopatria de longa
distância, mas a ocorrência de rearranjos cromossômicos, principalmente os relacionados ao
sexo, contribuíram para a fixação de diferenças genéticas que podem levar ao isolamento
reprodutivo e consequente processo de especiação dentro do gênero | por |
dc.publisher.initials | UFSCar | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA | por |
dc.publisher.address | Câmpus São Carlos | por |
dc.contributor.authorlattes | http://lattes.cnpq.br/3718742519898664 | por |
dc.publisher.course | Biotecnologia - Biotec | por |