dc.contributor.author | Lima, Isadora Soares de | |
dc.date.accessioned | 2023-04-17T14:43:08Z | |
dc.date.available | 2023-04-17T14:43:08Z | |
dc.date.issued | 23-03-24 | |
dc.identifier.citation | LIMA, Isadora Soares de. Análise in silico para definição de common core microbiano associado a condições com degradação de surfactante aniônico alquilbenzeno linear sulfonado (LAS). 23. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) – Universidade Federal de São Carlos, Sorocaba, 23. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/17760. | * |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/17760 | |
dc.description.abstract | Linear alkylbenzene sulfonate (LAS) is the anionic surfactant of greatest economic
interest worldwide. Its biodegradation route involves reactions of fumarate addition,
β-oxidation, cleavage of the aromatic ring and desulfonation. Since this is a complex process,
the use of varied sets of microorganisms makes it possible to take advantage of different
metabolisms and enzymes in the degradation of LAS. However, there is a lack of literature on
the microorganisms that play a key role in the degradation of surfactant in biological reactors.
This study aimed to define the microbial common core associated with the degradation of
anionic surfactant linear alkylbenzene sulfonate in bioreactors, from data mining available in
public databases containing raw 16S rRNA gene sequences. Forty-six 16S rRNA gene
samples, obtained from 12 scientific papers, were analyzed using bioinformatics tools
combined with a workflow in R software. The most abundant genera among the samples were
Methanosaeta (4.6%) and C39 (2.3%). The genus SJA-28 was predominant in the common
core clusters and was present in six of the seven clusters constructed, followed by the
Reyranella and Christensenellaceae R-7 group, found in five common cores, and Candidatus
Magasanikbacteria, in four cores. By functional profile analysis, enzymes were found related
to the fumarate addition, desulfonation and β-oxidation steps of LAS biodegradation. | eng |
dc.description.sponsorship | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) | por |
dc.language.iso | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de São Carlos | por |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | biodegradação | por |
dc.subject | gene 16S RNAr | por |
dc.subject | diversidade biológica | por |
dc.subject | água de lavanderia | por |
dc.subject | biodegradation | eng |
dc.subject | biological diversity | eng |
dc.subject | laundry water | eng |
dc.title | Análise in silico para definição de common core microbiano associado a condições com degradação de surfactante aniônico alquilbenzeno linear sulfonado (LAS) | por |
dc.title.alternative | In silico analysis for definition of microbial common core associated with condition with surfactant degradation sulphonated linear alkylbenzene anionic (LAS) | eng |
dc.type | TCC | por |
dc.contributor.advisor1 | Duarte, Iolanda Cristina Silveira | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/2626035341263254 | por |
dc.contributor.advisor-co1 | Delforno, Tiago Palladino | |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/8149468011291406 | por |
dc.description.resumo | O alquilbenzeno linear sulfonado (LAS) é o tensoativo aniônico de maior interesse
econômico mundial. Sua rota de biodegradação envolve reações de adição de fumarato,
β-oxidação, clivagem do anel aromático e dessulfonação. Por se tratar de um processo
complexo, o uso de conjuntos variados de microrganismos possibilita o aproveitamento de
diferentes metabolismos e enzimas na degradação do LAS. No entanto, há falta de literatura
sobre os microrganismos que desempenham um papel fundamental na degradação do
surfactante em reatores biológicos. Este estudo teve como objetivo definir o common core
microbiano associado à degradação do surfactante aniônico alquilbenzeno linear sulfonado
em biorreatores, a partir da mineração de dados disponíveis em bancos de dados públicos
contendo sequências brutas do gene 16S rRNA. Quarenta e seis amostras do gene 16S rRNA,
obtidas de 12 artigos científicos, foram analisadas usando ferramentas de bioinformática
combinadas com um fluxo de trabalho no software R. Os gêneros mais abundantes entre as
amostras foram Methanosaeta (4,6%) e C39 (2,3%). O gênero SJA-28 foi predominante nos
núcleos comuns e esteve presente em seis dos sete núcleos construídos, seguido por
Reyranella e Christensenellaceae R-7 group, encontrado em cinco núcleos comuns, e
Candidatus Magasanikbacteria, em quatro núcleos. Pela análise do perfil funcional, foram
encontradas enzimas relacionadas às etapas de adição de fumarato, dessulfonação e
β-oxidação da biodegradação do LAS | por |
dc.publisher.initials | UFSCar | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA | por |
dc.description.sponsorshipId | 2020/04297-1 | por |
dc.publisher.address | Câmpus Sorocaba | por |
dc.contributor.authorlattes | http://lattes.cnpq.br/0559446683939243 | por |
dc.publisher.course | Ciências Biológicas - CB-So | por |