dc.contributor.author | Felix, Mariana Campanha | |
dc.date.accessioned | 2022-05-26T19:24:03Z | |
dc.date.available | 2022-05-26T19:24:03Z | |
dc.date.issued | 2022-03-08 | |
dc.identifier.citation | FELIX, Mariana Campanha. Diversidade genética e estruturação populacional em capivaras, Hydrochoerus hydrochaeris (Linnaeus, 1766). 2022. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Recursos Naturais) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2022. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/16198. | * |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/16198 | |
dc.description.abstract | Decreased connectivity for species and consequently limited dispersal can be linked
to various environmental factors such as climate, dispersal barriers, or limited
dispersal. In the case of semi-aquatic organisms such as capybara, their dispersion
can be influenced by the presence of water bodies. Our work aims to evaluate the
distribution of genetic diversity of Hydrochoerus hydrochaeris in river basins of South
America. We also evaluated the presence of structuring between different
hydrographic basins and between hydrographic microbasins of the Paraguay and Alto
Paraná basins in Brazilian territory. For this, we amplified a fragment of the D-loop
region of mitochondrial DNA, constructed haplotype networks and performed
phylogenetic and molecular analysis of variance. We also reconstructed a
demographic history with the Bayesian Skyline Plot analysis. Our results showed that
H. hydrochaeris populations are structured between the Orinoco, Paraguay and Alto
Paraná basins, but still maintain ancestral polymorphisms and possibly a flow of
individuals between the Paraguay and Alto Paraná basins. On the other hand, the
genetic diversity, both haplotypic and nucleotide, in the Paraguay and Alto Paraná
basins is high and the populations show a relatively recent demographic growth, the
populations of the Orinoco basin show low diversity and a population decline. The
patterns of structure and genetic diversity are probably a result of the distinct
evolutionary history of watersheds and recent demographic fluctuations suffered by
populations, respectively. | eng |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | por |
dc.language.iso | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de São Carlos | por |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | Rodentia | por |
dc.subject | Fluxo gênico | por |
dc.subject | Barreiras geográficas | por |
dc.subject | Haplótipos D-loop | por |
dc.subject | Gene flow | eng |
dc.subject | Geographical barriers | eng |
dc.subject | D-loop haplotypes | eng |
dc.title | Diversidade genética e estruturação populacional em capivaras, Hydrochoerus hydrochaeris (Linnaeus, 1766) | por |
dc.title.alternative | Genetic diversity and population structure in capybaras, Hydrochoerus Hydrochaeris (Linnaeus, 1766) | eng |
dc.type | Dissertação | por |
dc.contributor.advisor1 | Galetti Júnior, Pedro Manoel | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/7398754661670478 | por |
dc.description.resumo | A diminuição da conectividade para as espécies e consequentemente limitação da dispersão pode estar ligada a vários fatores ambientais como clima, barreiras de dispersão, ou dispersão limitada. No caso de organismos semi-aquáticos, como a capivara, sua dispersão é influenciada pela presença de corpos d’água. Neste trabalho avaliamos a distribuição da diversidade genética de Hydrochoerus hydrochaeris em diferentes bacias hidrográficas da América do Sul. Avaliamos, também, a presença de estruturação entre diferentes bacias hidrográficas e entre microbacias hidrográficas das bacias do Paraguai e do Alto Paraná em território brasileiro. Para isso, amplificamos um fragmento da região D-loop do DNA mitocondrial, construímos redes de haplótipos e realizamos análises filogenética e de variância molecular. Também reconstruímos uma história demográfica com a análise Bayesian Skyline Plot. Nossos resultados evidenciaram que as populações de H. hydrochaeris encontram-se estruturadas entre as bacias do Orinoco, Paraguai e Alto Paraná, mas ainda mantêm polimorfismos ancestrais e possivelmente um fluxo de indivíduos entre as bacias do Paraguai e Alto Paraná. Enquanto a diversidade genética, tanto haplotípica quanto nucleotídica, nas bacias do Paraguai e Alto Paraná é elevada e as populações apresentam um crescimento demográfico relativamente
recente, as populações da bacia do Orinoco apresentam baixa diversidade e um declínio populacional. Os padrões de estrutura e diversidade genética provavelmente são resultado da história evolutiva distinta das bacias hidrográficas e recentes oscilações demográficas sofridas pelas populações, respectivamente. | por |
dc.publisher.initials | UFSCar | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Recursos Naturais - PPGERN | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA | por |
dc.description.sponsorshipId | 132482/2020-7 | por |
dc.publisher.address | Câmpus São Carlos | por |
dc.contributor.authorlattes | http://lattes.cnpq.br/4847446491505937 | por |