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dc.contributor.authorMonteiro, Vinícius Marquioni
dc.date.accessioned2022-09-28T18:37:42Z
dc.date.available2022-09-28T18:37:42Z
dc.date.issued2022-09-16
dc.identifier.citationMONTEIRO, Vinícius Marquioni. Isolamento e caracterização de vB_XciM_LucasX, um novo bacteriófago lítico de Xanthomonas citri e Xanthomonas fuscans. 2022. Tese (Doutorado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2022. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/16713.*
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/16713
dc.description.abstractCitrus canker, which is caused by the bacteria Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans, is one of the main diseases that affect the citrus industry in Brazil. Disease control methods are available, but new methods are necessary. A possible way to combat citrus canker is biocontrol using bacteriophages, also called phages, which are viruses that infect bacteria and which have been proposed as an alternative to the use of other antibacterial methods for agriculture and human health. The objectives of this doctoral project were the isolation, sequencing and characterization of one or more phages capable of infecting Xanthomonas citri, as well as to assess their potential for biocontrol of citrus canker. From a soil sample collected in a citrus grove affected by citrus canker, we could isolate a phage capable of infecting X. citri, strain 306, also known as Xac 306. The phage has a 305,651-bp, dsDNA genome, with a GC content of 54.92% and three hundred ninety-four ORFs, for one hundred eighty-one of which it was possible to assign functions while two hundred and thirteen remained as hypothetical. Phylogenetic and microscopy analysis allowed the classification of the phage in the Myoviridae family and it was named vB_XciM_LucasX. LucasX infected twenty-one of the twenty-three strains of X. citri and X. fuscans against which it was tested. A pangenomic analysis with the strains whose genome is available indicated that a 40-kbp region is present in all susceptible strains, but absent in the resistant strain, and which must contain genes essential for phage infection. LucasX can be propagated in NB medium but not in LB medium, probably because it is not tolerant to NaCl. LucasX is stable up to 45oC, has a latent period of 90 min and a burst size of 40 PFU/infected cell, its optimal pH is 7 and it can be inactivated with 40% ethanol or by being exposed to UV light from a germicidal lamp. The phage yield in liquid medium was studied in three strains of Xanthomonas sp. and it was one order of magnitude higher in one of them relative to the strain used for isolation. Finally, an experiment with citrus trees kept in a greenhouse showed that LucasX is able to reduce the number of lesions caused by Xac 306 by up to 89%%, a reduction similar to that of a commercial bactericide used as a control, thus indicating its potential as a biocontrol agent for citrus canker.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)por
dc.language.isoporpor
dc.publisherUniversidade Federal de São Carlospor
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.subjectBacteriófagospor
dc.subjectXanthomonaspor
dc.subjectCancro cítricopor
dc.subjectControle biológicopor
dc.subjectBacteriophageseng
dc.subjectCitrus cankereng
dc.subjectBiocontroleng
dc.titleIsolamento e caracterização de vB_XciM_LucasX, um novo bacteriófago lítico de Xanthomonas citri e Xanthomonas fuscanspor
dc.title.alternativeIsolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new lytic phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscanseng
dc.typeTesepor
dc.contributor.advisor1Novo-Mansur, Maria Teresa Marques
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1198926223396748por
dc.description.resumoO cancro cítrico, causado pelas bactérias Xanthomonas citri e Xanthomonas fuscans, é uma das principais doenças que afetam a citricultura brasileira e mundial. Métodos de controle da doença estão disponíveis, mas novos métodos são necessários. Uma possível forma de combate ao cancro cítrico seria o controle biológico usando bacteriófagos, também chamados de fagos, que são vírus que infectam bactérias e que têm sido propostos como uma alternativa ao uso de outros métodos antibacterianos na agropecuária e na saúde humana. Os objetivos desse trabalho de doutorado eram isolar, sequenciar e caracterizar um ou mais fagos capazes de infectar Xanthomonas citri, bem como avaliar seu potencial para controle biológico do cancro cítrico. A partir de uma amostra de terra coletada em um laranjal acometido pelo cancro cítrico foi possível isolar um fago capaz de infectar X. citri, linhagem 306, também chamada de Xac 306. O fago tem um genoma de dsDNA de 305.651 pb, possui um conteúdo de GC de 54,92% e trezentas e noventa e quatro ORFs, para cento e oitenta e uma das quais foi possível atribuir funções enquanto duzentas e treze permaneceram como ORFs hipotéticas. As análises filogenética e de microscopia permitiram classificar o fago na família Myoviridae e ele foi denominado vB_XciM_LucasX. LucasX infectou vinte e uma das vinte e três linhagens de X. citri e X. fuscans contra as quais foi testado. Uma análise de pangenômica com as linhagens cujos genomas já foram sequenciados indicou que uma região de 40 kpb está presente em todas as linhagens suscetíveis, mas ausente na linhagem resistente, o qual deve conter genes essenciais à infecção pelo fago. LucasX pode ser propagado em meio NB mas não em meio LB, provavelmente por não ser resistente a NaCl. LucasX é estável até a 45oC, possui um tempo de latência de 90 min e um burst size de 40 UFP/célula infectada, seu pH ótimo é 7 e ele pode ser inativado em concentrações de etanol a partir de 40% ou ao ser exposto à luz UV de uma lâmpada germicida. O rendimento do fago ao ser propagado em meio líquido foi estudado em três linhagens de Xanthomonas sp. e foi uma ordem de grandeza maior em uma delas do que na linhagem usada no isolamento. Por fim, um experimento com mudas de laranjeira mantidas em estufa mostrou que LucasX é capaz de reduzir o número de lesões causadas pela infecção por Xac 306 em até 89%, valor equivalente ao de um bactericida comercial usado como controle, indicando seu potencial como agente de controle biológico do cancro cítrico.por
dc.publisher.initialsUFSCarpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvpor
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICApor
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIApor
dc.description.sponsorshipId88882.426704/2019-01por
dc.publisher.addressCâmpus São Carlospor
dc.contributor.authorlatteshttp://lattes.cnpq.br/7322282884244635por


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