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dc.contributor.authorSantos, Cesar Augusto dos
dc.date.accessioned2018-11-07T21:28:04Z
dc.date.available2018-11-07T21:28:04Z
dc.date.issued2018-08-28
dc.identifier.citationSANTOS, Cesar Augusto dos. DNA Barconding do gênero Schizodon (Characiformes, Anostomidae). 2018. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2018. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/10642.*
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/10642
dc.description.abstractFish of the Schizodon genus have important representation in the largest South American basins. Historically they underwent through several taxonomic revisions, due to their high phenotypic plasticity and the ontogenetic characters found among the species of this group. The goal of this work was to evaluate the congruence between the molecular units (MOTUs) and the nominal species currently valid, using the DNA barcoding and coalescent methods. DNA extraction, amplification and analysis of the mitochondrial COI region from 68 samples were performed; additionally, 19 sequences available on the BOLD system were added to the analyses. The CodonCode Aligner program was used to edit the sequences and alignment. The genetic distances were calculated in the MEGA 7 software, using the K2P model (Kimura 2-Parameters). For the distance-based species delimitation, the DNA barcoding method was used with three different values of thresholds (2%, 1.4% and 1%). Although evidencing different numbers of MOTUs, the results were congruent in suggesting a possible synonymy of S. jacuiensis and S. platae. With the thresholds 1.4% and 1%, S. vittatus was subdivided into two MOTUs, evidencing the existence of a potential cryptic species. These results were corroborated in the GMYC (Generalized Mixed Yule-coalescent) species delimitation analysis. Thus, the findings of this work show that there are disagreements between the molecular units and the currently valid taxonomy for the genus. This indicates that an extensive taxonomic revision, using morphological and molecular tools, which include different genes, is still needed for a better decision on the taxonomic status within the Schizodon genus.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)por
dc.language.isoporpor
dc.publisherUniversidade Federal de São Carlospor
dc.rights.uriAcesso abertopor
dc.subjectDNA barcodingpor
dc.subjectPeixepor
dc.subjectDelimitação de espéciepor
dc.subjectGMYCpor
dc.subjectMOTUpor
dc.subjectDNA barcodingeng
dc.subjectFisheng
dc.subjectSpecies delimitationeng
dc.titleDNA Barconding do gênero Schizodon (Characiformes, Anostomidae)por
dc.title.alternativeDNA Barcoding of gender Schizodon (Characiformes, Anostomidae)eng
dc.typeDissertaçãopor
dc.contributor.advisor1Galetti Júnior, Pedro Manoel
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7398754661670478por
dc.contributor.advisor-co1Ramirez Malaver, Jorge Luis
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3073682959497475por
dc.description.resumoOs peixes do gênero Schizodon possuem representação importante nas maiores bacias da América do Sul. Historicamente passaram por várias revisões taxonômicas, devido à alta plasticidade fenotípica e os caracteres ontogênicos encontrados entre as espécies desse grupo. O objetivo desse trabalho foi avaliar a congruência entre as unidades moleculares (MOTUs) e as denominações das espécies nominais de Schizodon reconhecidas como válidas na presente taxonomia, utilizando a ferramenta DNA barcoding. Foi realizada a extração do DNA e a amplificação e análise da região COI de 68 amostras; adicionalmente, 19 sequências disponíveis no BOLD system foram adicionadas à análise. Para edição das sequências e alinhamento fez-se uso do programa CodonCode Aligner. As distâncias genéticas foram calculadas no software MEGA 7, usando o modelo de substituição K2P (Kimura 2-Parâmetros). Para a delimitação de espécies baseada em distância, utilizou-se o método DNA barcoding com três valores diferentes de thresholds (2%, 1,4% e 1%). Embora evidenciando diferentes números de MOTUs, os resultados foram congruentes em sugerir uma possível sinonímia de S. jacuiensis e S. platae. Com os thresholds 1,4% e 1%, S. vittatus subdividiu-se em duas MOTUs, evidenciando a existência de uma espécie críptica dentro dessa denominação. Esses resultados foram corroborados na análise de delimitação de espécies do GMYC (Generalized Mixed Yule-coalescent). Assim, os achados desse trabalho mostram que há discordâncias e concordâncias entre as unidades moleculares e a taxonomia atualmente válida para o gênero, indicando a necessidade de uma revisão taxonômica extensa, utilizando ferramentas morfológicas e moleculares que incluam diferentes genes, para uma melhor decisão sobre o status taxonômico dentro do gênero Schizodon.por
dc.publisher.initialsUFSCarpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvpor
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICApor
dc.description.sponsorshipIdCAPES: 001por
dc.ufscar.embargoOnlinepor
dc.publisher.addressCâmpus São Carlospor
dc.contributor.authorlatteshttp://lattes.cnpq.br/1501242713892003por


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