dc.contributor.author | Fischer, Eliana Michelle Paviotti | |
dc.date.accessioned | 2019-02-05T16:41:39Z | |
dc.date.available | 2019-02-05T16:41:39Z | |
dc.date.issued | 2016-07-07 | |
dc.identifier.citation | FISCHER, Eliana Michelle Paviotti. Diversidade genética de Euphractus sexcinctus (Linnaeus, 1758) em áreas de Cerrado e Pantanal. 2016. Tese (Doutorado em Ecologia e Recursos Naturais) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2016. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/10908. | * |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/10908 | |
dc.description.abstract | Euphractus sexcinctus is a species of armadillo endemic to the South American continent, that
has wide distribution and occurs in all Brazilian biomes. Although generalist, with some tolerance
to environmental changes, the species is very threatened by anthropogenic pressures, mainly by
roadkill. Therefore, this study aimed to provide genetic information for the species, increasing the
understanding of the distribution of genetic diversity and its population genetic structure. To
access the genetic diversity of the species, its complete genome was sequenced by next generation
sequencing. From the sequencing data, the complete mitochondrial genome was assembled. The
mitogenoma was considered as subspecies level: Euphractus sexcinctus flavimanus. Besides
mitogenoma nuclear microsatellites markers were developed. These microsatellites were used to
evaluate the distribution of genetic diversity of the species in areas of Cerrado and Pantanal.
Molecular markers were used to identify the sex of the animals, since this identification was not
performed during collection. The possibility of molecular sexing in armadillos can be useful,
especially when studying carcasses. The data for mitochondrial genome of E. s. flavimanus
showed differences, mainly in the control region (D-loop) in comparison to the mitochondrial
genome of E. sexcinctus recently sequenced. Regarding the genetic diversity rates, high values
were observed for the species in all sampled areas, which is expected to not endangered species.
The Bayesian analysis and the molecular variance (AMOVA) analysis exposed a panmitic
population of E. sexcinctus in part of the Mato Grosso do Sul, including areas of Cerrado and
Pantanal. This fact should not discourage, however, conservation measures for the species, as
thought he factorial correspondence analysis (FCA) showed that individuals in some areas barely
overlap. In addition, the FST calculations indicated a significant, but very low, structuraction
between individuals of cerrado and Pantanal. Molecular sexing showed males are more run dwon
than females in two large sampled portions of the BR262. Data on roadkill showed several
hotsposts roadkill. This data is useful for taking mitigating measures. However, more detailed
data about the surrounding landscape become necessary to better understand the distribution of
roadkill on highways sampled and ecology of this species of armadillo. | eng |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) | por |
dc.language.iso | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de São Carlos | por |
dc.rights.uri | Acesso aberto | por |
dc.subject | Atropelamentos | por |
dc.subject | Genoma mitocondrial | por |
dc.subject | Microssatélites | por |
dc.subject | Roadkill | eng |
dc.subject | Mitochondrial genome | eng |
dc.subject | Microsatellites | eng |
dc.subject | Euphractus sexcinctus flavimanus | eng |
dc.title | Diversidade genética de Euphractus sexcinctus (Linnaeus, 1758) em áreas de Cerrado e Pantanal | por |
dc.type | Tese | por |
dc.contributor.advisor1 | Galetti Júnior, Pedro Manoel | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/7398754661670478 | por |
dc.contributor.advisor-co1 | Desbiez, Arnaud Léonard Jean | |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/1343726040328032 | por |
dc.description.resumo | Euphractus sexcinctus é uma espécie de tatu endêmica do continente Sul Americano, que
apresenta ampla distribuição geográfica e ocorre em todos os biomas brasileiros. Embora seja
generalista, com certa tolerância às alterações ambientais, a espécie é muito ameaçada por
pressões antrópicas, principalmente pelos atropelamentos. Diante disso, o presente estudo teve
como objetivo geral disponibilizar informações genéticas para a espécie, aumentando assim a
compreensão sobre a distribuição de sua diversidade genética e sua estrutura genética
populacional. Para acessar a diversidade genética da espécie, seu genoma completo foi
sequenciado por sequenciamento de próxima geração. A partir dos dados do sequenciamento, o
genoma mitocondrial completo da espécie foi montado. O mitogenoma foi considerado em nível
de subespécie: Euphractus sexcinctus flavimanus. Além do mitogenoma, foram desenvolvidos
marcadores nucleares do tipo microssatélites, os quais foram utilizados para avaliar a distribuição
da diversidade genética da espécie em áreas de Cerrado e Pantanal. Foram utilizados marcadores
moleculares para a identificação do sexo dos animais, já que o gênero dos mesmos não foi
identificado durante as coletas. A possibilidade de realizar a sexagem molecular em tatus pode
ser particularmente útil quando se estuda carcaças. Os dados obtidos para o genoma mitocondrial
de E. s. flavimanus evidenciaram diferenças, principalmente na região controle (D-loop), em
relação ao genoma mitocondrial de E. sexcinctus recentemente sequenciado. Quanto aos índices
de diversidade genética, foram observados valores altos para a espécie em todas as áreas
amostradas, o que é esperado para espécies não ameaçadas. As análises bayesianas e a
AMOVA evidenciaram uma população panmítica de E. sexcinctus em parte do Mato
Grosso do Sul, incluindo áreas de Cerrado e Pantanal. Tal fato não deve desencorajar,
entretanto, medidas de conservação para a espécie, já que a análise de correspondência
fatorial evidenciou que indivíduos de algumas áreas quase não se sobrepõem. Além disso,
os valores de FST indicaram uma significativa, mas muito baixa, estruturação entre indivíduos do
Cerrado e do Pantanal. A sexagem molecular indicou que machos são mais atropelados do que
fêmeas em dois grandes trechos da BR262/MS. Foram encontrados diversos hotsposts de
atropelamentos. Esses dados são úteis para tomada de medidas mitigadoras. No entanto,
dados mais detalhados sobre a paisagem do entorno tornam-se necessários para o melhor
entendimento da distribuição dos atropelamentos nas rodovias amostradas e da ecologia
dessa espécie de tatu. | por |
dc.publisher.initials | UFSCar | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Recursos Naturais - PPGERN | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA | por |
dc.ufscar.embargo | Online | por |
dc.publisher.address | Câmpus São Carlos | por |
dc.contributor.authorlattes | http://lattes.cnpq.br/5978732027340421 | por |