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Métodos de colapsagem de variantes raras para mapeamento de QTLs

dc.contributor.authorJoão, Lara Midena
dc.date.accessioned2024-02-15T19:00:05Z
dc.date.available2024-02-15T19:00:05Z
dc.date.issued2024-01-30
dc.identifier.citationJOÃO, Lara Midena. Métodos de colapsagem de variantes raras para mapeamento de QTLs. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Estatística) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2024. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/19304.*
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/19304
dc.description.abstractThe mapping of regions in the genome associated with quantitative traits (QTLs) through SNP-type genetic markers has been one of the central problems in Genetics and Molecular Biology and several methods of detection and identification of QTLs have been proposed in the literature. In this work, we research, study and describe the main methods that have been used for this purpose in independent data with the presence of rare variants. We also highlight its advantages and disadvantages and list the algorithms that are already implemented and available for use. The performance of the different methodologies studied was compared via GAW 17 data analysis.eng
dc.description.sponsorshipNão recebi financiamentopor
dc.language.isoporpor
dc.publisherUniversidade Federal de São Carlospor
dc.rightsAttribution-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/*
dc.subjectDados independentespor
dc.subjectGAW 17por
dc.subjectVariantes raraspor
dc.subjectIndependent dataeng
dc.subjectRare variantseng
dc.titleMétodos de colapsagem de variantes raras para mapeamento de QTLspor
dc.title.alternativeRare variant collapsing methods for QTLs mappingeng
dc.typeTCCpor
dc.contributor.advisor1Zuanetti, Daiane Aparecida
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8352484284929824por
dc.description.resumoO mapeamento de regiões no genoma associadas a traços quantitativos (QTLs) através de marcadores genéticos do tipo SNP tem sido um dos problemas centrais em Genética e Biologia Molecular e vários métodos de detecção e identificação de QTLs têm sido propostos na literatura. Neste trabalho, pesquisamos, estudamos e descrevemos os principais métodos que têm sido utilizados para esse fim em dados independentes na presença de variantes raras. Também destacamos suas vantagens e desvantagens e elencamos os algoritmos que já estão implementados e disponíveis para utilização. O desempenho das diferentes metodologias estudadas foi comparado via análise dos dados GAW 17.por
dc.publisher.initialsUFSCarpor
dc.subject.cnpqCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::PROBABILIDADE E ESTATISTICA::ESTATISTICA::REGRESSAO E CORRELACAOpor
dc.publisher.addressCâmpus São Carlospor
dc.contributor.authorlatteshttp://lattes.cnpq.br/2424988204417773por
dc.publisher.courseEstatística - Espor
dc.contributor.advisor1orcidhttps://orcid.org/0000-0003-1591-959Xpor


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Relatório do TCC
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