Modelos HMM com dependência de segunda ordem: aplicação em genética

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dc.contributor.advisor1Milan, Luis Aparecido
dc.contributor.authorZuanetti, Daiane Aparecida
dc.date.accessioned2016-06-02T20:06:12Z
dc.date.available2007-07-10
dc.date.available2016-06-02T20:06:12Z
dc.date.issued2006-02-20
dc.description.abstract(See full text for download)eng
dc.description.resumoA crescente necessidade do desenvolvimento de eficientes técnicas computacionais e estatísticas para analisar a profusão de dados biológicos transformaram o modelo Markoviano oculto (HMM), caso particular das redes bayesianas ou probabilísticas, em uma alternativa interessante para analisar sequências de DNA. Uma razão do interesse no HMM é a sua flexibilidade em descrever segmentos heterogêneos da sequência através de uma mesma estrutura de dependência entre as variáveis, supostamente conhecida. No entanto, na maioria dos problemas práticos, a estrutura de dependência não é conhecida e precisa ser também estimada. A maneira mais comum para estimação de estrutra de um HMM é o uso de métodos de seleção de modelos. Outra solução é a utilização de metodologias para estimação da estrutura de uma rede probabilística. Neste trabalho, propomos o HMM de segunda ordem e seus estimadores bayesianos, definimos o fator de Bayes e o DIC para seleção do HMM mais adequado a uma sequência específica, verificamos seus desempenhos e a performance da metodologia proposta por Friedman e Koller (2003) em conjunto de dados simulados e aplicamos estas metodologias em duas sequências de DNA: o intron 7 do gene a - fetoprotein dos cimpanzés e o genoma do parasita Bacteriophage lambda, para o qual o modelo de segunda ordem é mais adequado.por
dc.description.sponsorshipUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.formatapplication/pdfpor
dc.identifier.citationZUANETTI, Daiane Aparecida. Modelos HMM com dependência de segunda ordem: aplicação em genética. 2006. 97 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006.por
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/4598
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de São Carlospor
dc.publisher.countryBRpor
dc.publisher.initialsUFSCarpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Estatística - PPGEspor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectEstatística matemáticapor
dc.subjectModelo markoviano ocultopor
dc.subjectRedes probabilísticaspor
dc.subjectOrdem de dependênciapor
dc.subjectSeleção de modelospor
dc.subjectMCMCpor
dc.subjectHidden Markov modeleng
dc.subjectProbabilistic networkseng
dc.subjectOrder of dependenceeng
dc.subjectModel selectioneng
dc.subjectMCMCeng
dc.subject.cnpqCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::PROBABILIDADE E ESTATISTICA::ESTATISTICApor
dc.titleModelos HMM com dependência de segunda ordem: aplicação em genéticapor
dc.typeDissertaçãopor

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