SARS-CoV-2: detecção colorimétrica e eletroquímica do RNA viral em amostras de saliva humana

dc.contributor.advisor1Faria, Ronaldo Censi
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8659496864305621
dc.contributor.authorMiranda, Wyllian Neves
dc.contributor.authorlatteshttp://lattes.cnpq.br/9138345426331181
dc.contributor.refereeLeite, Oldair Donizeti
dc.contributor.refereeLopes, Mauro Chirici
dc.contributor.refereeSouza, Ernesto Chaves Pereira de
dc.contributor.refereeSitta, Elton Fabiano
dc.contributor.refereeLatteshttp://lattes.cnpq.br/8436215509083608
dc.contributor.refereeLatteshttp://lattes.cnpq.br/9184566860150155
dc.contributor.refereeLattesttp://lattes.cnpq.br/1505400360366643
dc.contributor.refereeLatteshttp://lattes.cnpq.br/4326476348284298
dc.date.accessioned2025-09-25T12:01:37Z
dc.date.issued2025-07-07
dc.description.abstractSARS-CoV-2: Colorimetric and electrochemical detection of viral RNA in human saliva samples. The emergence and rapid spread of respiratory and systemic viruses have significantly marked the global health scenario in recent decades. From HIV to SARS-CoV-2, viral agents have caused health crises with high human and economic costs, reinforcing the importance of effective surveillance, diagnosis, and containment strategies. Despite the reduction in deaths due to vaccination, mass testing remains an essential measure, but still insufficient in Brazil due to limitations in cost, accessibility, and infrastructure. This work aimed to develop simpler, faster, and lower-cost molecular assays for the detection of SARS-CoV-2 RNA in saliva samples. Two methods were proposed: a colorimetric method, compatible with microtubes or 96-well microplates, and an electrochemical method, applicable in unit cells or arrays of eight cells. The assays are based on the use of magnetic particles functionalized with carboxyl groups to capture the target by anchoring DNA probes complementary to the sequences of the N gene, present in the SARS-CoV-2 RNA. Detection and quantification are performed without the need for electrode modification, extraction or amplification of genetic material. The experimental conditions were optimized and tested both on fortified saliva samples and on real samples from patients already diagnosed using the standard technique. Limits of detection and quantification ranging from fmol L⁻¹ to pmol L⁻¹ with a wide linear range were obtained. The sensitivity and specificity of the methods were determined by constructing a ROC curve for predictive analysis and compared to the standard RT-PCR method.eng
dc.description.resumoSARS-CoV-2: Detecção colorimétrica e eletroquímica do RNA viral em amostras de saliva humana. O surgimento e a rápida disseminação de vírus respiratórios e sistêmicos têm marcado de forma significativa o cenário da saúde global nas últimas décadas. Do HIV ao SARS-CoV-2, agentes virais têm provocado crises sanitárias com alto custo humano e econômico, reforçando a importância de estratégias eficazes de vigilância, diagnóstico e contenção. Apesar da redução nos óbitos devido à vacinação, a testagem em massa continua sendo uma medida essencial, mas ainda insuficiente no Brasil devido às limitações de custo, acessibilidade e infraestrutura. Este trabalho teve como objetivo desenvolver ensaios moleculares mais simples, rápidos e de menor custo para detecção do RNA do SARS-CoV-2 em amostras de saliva. Foram desenvolvidos dois métodos: um colorimétrico, compatível com microtubos ou microplacas de 96 poços, e outro eletroquímico, aplicável em células unitárias ou arranjos de oito células. Os ensaios são baseados no uso de partículas magnéticas funcionalizadas com grupos carboxila para a captura do alvo a partir do ancoramento de sondas de DNA complementares às sequências do gene N, presente no RNA de SARS-CoV-2. A detecção e quantificação são realizadas sem necessidade de etapas de modificação do eletrodo, extração ou amplificação do material genético. As condições experimentais foram otimizadas e testadas tanto em amostras de saliva fortificadas quanto em amostras reais de pacientes já diagnosticados pela técnica padrão. Foram obtidos limites de detecção e quantificação que variam de fmol L⁻¹ a pmol L⁻¹ com ampla faixa linear, a sensibilidade e especificidade dos métodos foram determinados a partir da construção de uma curva ROC de análise preditiva e comparados ao método padrão RT-PCR.por
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
dc.identifier.citationMIRANDA, Wyllian Neves. SARS-CoV-2: detecção colorimétrica e eletroquímica do RNA viral em amostras de saliva humana. 2025. Tese (Doutorado em Química) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2025. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/20.500.14289/22823.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14289/22823
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Carlos
dc.publisher.addressCampus São Carlos
dc.publisher.initialsUFSCar
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Química - PPGQ
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
dc.subjectCOVID19
dc.subjectSARS-CoV-2
dc.subjectElectrochemicaleng
dc.subjectDetectioneng
dc.subject.cnpqCIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA::QUIMICA ANALITICA::ELETROANALITICA
dc.titleSARS-CoV-2: detecção colorimétrica e eletroquímica do RNA viral em amostras de saliva humanapor
dc.title.alternativeSARS-CoV-2: colorimetric and electrochemical detection of viral RNA in human saliva sampleseng
dc.typeTese

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